Приводятся современные данные биохимических процессов, вызываемых микроорганизмами в аквасреде, рассматриваются влияние экологических факторов на микроорганизмы, инфекции и иммунитет, патогенная микрофлора, передающаяся через воду, санитарно-микробиологическая характеристика и оценка качества сточных и природных вод, зоны сапробности, микробиологические основы очистки, самоочищения природных и сточных вод, бактериальная продукция и методы ее определения, роль микроорганизмов в повышении рыбопродуктивности аквасреды, микрофлора живой рыбы. Учебник предназначен для студентов высших учебных заведений, обучающихся по направлениям подготовки «Науки о Земле», «Промышленная экология и биотехнологии», «Техносферная безопасность и природообустройство», «Сельское, лесное и рыбное хозяйство», «Ветеринария и зоотехния».