22.06.1941, после получения известия о нападении Германии на СССР, отряд был приведен в полную боевую готовность и до 02.07.1941 продолжал выполнять задачу по охране зоны пограничного заграждения, выполняя с 23.06.1941 задачи по оперативно-войсковой разведке и по выявлению и ликвидации разведывательно-диверсионных групп и парашютных десантов противника.

      Одновременно осуществлялась эвакуация складов мобресурсов и семей комначсостава.

      По указанию Наркома внутренних дел СССР от 26.06.1941 №31 «Об организации охраны тыла Действующей Красной Армии» отряд вошел в оперативное подчинение начальнику охраны тыла Западного фронта.

      27.06.1941, вследствие участившихся налетов немецкой авиации на военный городок отряда, штаб отряда с приштабными подразделениями передислоцировался в лес, заняв оборону на левом берегу р. Березина в 1,5 км от местечка.

      В этот день разведкой 5-й пограничной комендатуры в районе пос. Илья был взят в плен немецкий офицер с оперативными документами, который после допроса был передан в оперативный отдел 50-й стрелковой дивизии генерал-майора В. П. Евдокимова.

      Также 27.06.1941 отделение Плещеницкого узла связи в составе восьми пограничников, получив приказ ликвидировать повреждение линии связи Плещеницы – Минск, около г. Логойск, на 41 км шоссе Минск – Плещеницы столкнулось с головным дозором танковой колонны немцев. Пограничники связками гранат подбили два танка, огнем из винтовок уничтожили экипажи. В бою погиб линейный надсмотрщик красноармеец Борис Сергеевич Старков.

      К исходу дня немцы заняли г. Глубокое, 28 июня – г. Вилейку, а 29 июня вышли на участок 5-й пограничной комендатуры и по приказу начальника отряда удаленные заставы были передислоцированы к КП комендатур. В этот же день РПГ 10-й заставы в составе 17 пограничников была ликвидирована диверсионная группа противника численностью 7 человек: двое были убиты, двое ранены и взяты в плен.

      31.06.1941, в связи с угрозой захвата немцами Плещениц и Бегомля, подразделения 5-й комендатуры передислоцировались в район м. Березино к управлению отряда.

      01.07.1941 штаба отряда и подразделения 3-й, 4-й и 5-й комендатур вместе с частями Красной Армии начали отход к пос. Боровка, что на шоссе Лепель – Витебск и к исходу 02.07.1941 вышли на рубеж г. Лепель – пос. Боровка.

      02.07.1941 около 15.00 передовые части 39-го танкового корпуса 3-й танковой группы немецких войск по шоссе Бегомль – Витебск достигли р. Березина и вступили в бой с подразделениями отряда, охранявшими мост. Пограничники были вынуждены отступить, взорвав мост.

      03.07.1941 в 20.00 отряд получил приказ от начальника Лепельского военного гарнизона – командующего Лепельской оперативной группой войск Западного фронта оборудовать оборонительный рубеж в 12 км северо-западнее г. Лепель по линии оз. Воронь – д. Воронь – д. Старое Село.

      В это же день 1-я и 2-я комендатуры, продолжавшие нести службу по охране зоны пограничного заграждения, получили приказ отходить вместе с частями