Отдел «А» (учетно-архивный)

      Отдел «Б» (применение оперативной техники)

      Отдел «В» (перлюстрации корреспонденции)

      Отдел «Д» (изготовление и экспертиза документов)

      Отдел«ДР»(диверсионно-разведывательный,9.9.1950 г. на базе Отдела были созданы Бюро №1 (спецоперации за рубежом) и Бюро №2 (спецоперации внутри страны))

      Отдел «К»

      Отдел оперативной техники

      Финансовый отдел

      Юридическое бюро

      Тюремный отдел

      Шифровальный отдел (с 11.1.1950 г., 18.8.1950 г. переименован в Отдел «С»)

      Плановый отдел

      Спецотдел (с 21.4.1949 г. для руководства Государственным хранилищем ценностей – Гохраном)

      Центральная бухгалтерия (с 28.7.1948 г.)

      Центральное бюро по рационализации и изобретательству (с 26.1 .1 953 г.)