COVID-19/SARS-CoV-2. Александр Герасимович
Читать онлайн книгу.
85 стран. Пятью странами, сообщающими о самой высокой распространенности ВА.2.75, являются Таиланд (53,8%), Австралия (25,1%), Малайзия (22,5%), Китай (18,8%) и Новая Зеландия (16,3%). BA.2.75 быстро стал доминирующим в Индии и Бангладеш; но затем был заменен на XBB без указания на значительное увеличение частоты зарегистрированных случаев. Судя по имеющимся в настоящее время данным, BA.2.75 не показал существенного отличия фенотипа от других штаммов Omicron в странах, где он распространился.
Подштамм BA.5 с одной или несколькими из 5 мутаций S:R346X, S:K444X, S:V445X, S:N450X и/или S:N460X находится под наблюдением, поскольку эти мутации были связаны с важной функциональной ролью вируса (например, устойчивость к нейтрализации, повышенная трансмиссивность). Этот класс штаммов быстро увеличивается и был обнаружен в 119 странах с общей распространенностью 15,0%. Пять стран, сообщающих о самой высокой распространенности ВА.5, – это Южная Африка (75,4%), Коста-Рика (70,9%), Перу (53,5%), Мексика (49,8%) и Бразилия (42,4%).
Подштамм BQ.1 является потомком BA.5 с дополнительными заменами S:K444T и S:N460K. Линия потомков BQ.1 с наибольшей распространенностью – это BQ.1.1, несущая дополнительную мутацию S:R346T. BQ.1 является одним из самых быстрорастущих штаммов и распространился на 90 стран. Пятью странами с самой высокой распространенностью штамма BQ.1 являются Эквадор (65,5%), Португалия (56,7%), Испания (54,1%), Франция (48,7%) и Колумбия (46,8%).
BA.2.30.2 содержит мутации S:K444R, S:N450D, S:L452M, S:N460K и S:E484R. В конце 2022 года глобальная распространенность BA.2.30.2 составляла 0,3%. Странами с самой высокой распространенностью были Исландия (4%), Словения (2%), Австралия (1,1%), Колумбия (0,9%) и Республика Корея (0,6%). (Еженедельный эпидемиологический обзор COVID-19. Выпуск 122, опубликованный 14 декабря 2022 г.)
Перечень всех штаммов с мутациями доступен по ссылке: covdb.stanford.edu/page/mutation-viewer.
Цифры курсивом рядом с текстом таблиц указывают на источники информации.
Характеристики штаммов SARS-CoV-2. Значимые штаммы VОС и VOI были переименованы буквами греческого алфавита. 1/2
Характеристики штаммов SARS-CoV-2. Значимые штаммы VОС и VOI были переименованы буквами греческого алфавита. 2/2
* covdb.stanford.edu/page/mutation-viewer
** Weekly_Epi_Update_55
*** https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants#
P J Halfmann et al., 2022
Подштаммы Omicron VOC, 16.01.2023 г. (Weekly Epi Update 126).
# включая потомки; * дополнительные мутации вне белка S: N: G30-, S33F, ORF9b: M26-, A29I, V30L; $ дополнительные мутация вне белка S: ORF1a: Q556K, L3829F, ORF1b: Y264H, M1156I, N1191S, N: E136D, ORF9b: P10F; § дополнительные мутации вне белка S: ORF1a: S1221L, P1640S, N4060S, ORF1b: G662S, E: T11A; ** дополнительные мутации вне белка S: ORF1a: K47R, ORF1b: G662S, S959P, E: T11A, ORF8: G8*.
Фенотипические характеристики штаммов, Weekly Epi Update ВОЗ. Издание 78, опубликовано 8.02.2022 г.
Фенотипические характеристики подштаммов Омикрон, COVID-19 Weekly Epi Update ВОЗ. Выпуск 119, опубликованный 23.11.2022 г. 1/3
Фенотипические характеристики подштаммов Омикрон, COVID-19 Weekly Epi Update ВОЗ. Выпуск 119, опубликованный 23.11.2022 г. 2/3
Фенотипические характеристики подштаммов Омикрон, COVID-19 Weekly Epi Update ВОЗ. Выпуск